В конце войны летчик Коити Сикисима совершил вынужденную посадку на острове Одо. Там находилась секретная ремонтная база японской армии. С наступлением темноты базу атаковало гигантское существо — местные жители шептали его имя, Годзилла. Коити чудом остался жив.
Он вернулся в Токио, но город лежал в руинах. От родительского дома не осталось ничего. Сам он теперь был совсем один. Случайно он встретил молодую женщину с ребенком — она, как и он, потеряла всех. Девочку она спасла во время бомбежки. Они стали держаться вместе, пытаясь выжить среди пепла.
Шли месяцы. Постепенно жизнь начала налаживаться. Коити устроился на опасную работу — в составе группы он обезвреживал неразорвавшиеся мины в водах Токийского залива. Работали они на старом деревянном суденышке, хрупком и ненадежном.
Однажды во время обычного выхода тихую воду внезапно вздыбила чудовищная спина. Это был Он. Годзилла. Но теперь он был огромен, как гора, и дышал яростью. Говорили, его разбудили новые испытания где-то далеко в океане. И теперь он пришел сюда.